まずはユーザー登録です！その後、郵送で、ログインに必要な書類が送られてきます。

書類が到着しましたら、１カ月を目安にログインしてください。

https://www.npo-homepage.go.jp/npoportal/faq/common#q19

「書類を郵送してから１カ月以上経過してもログインがなかった場合は、新規ユーザ登録またはログインID再発行の際にご入力いただいた内容は破棄されます。 法人専用ログイン画面にある「ログインID再発行」から申請をお願いします。」